Prof. Dr. Alexander Dilthey und Dr. Torsten Houwaart erzählen
darüber, wie sie durch bioinformatische Methoden die Spur von
SARS-CoV2 nach Deutschland nachverfolgen konnten, wie sie jetzt
die Varianten-Überwachung im Raum Düsseldorf machen und warum man
dafür sowohl Maschinelles Lernen als auch
High-Performance-Computing braucht.
Artikel:
Andreas Walker, Torsten Houwaart2, Tobias Wienemann, Malte Kohns
Vasconcelos, Daniel Strelow, Tina Senff, Lisanna Hülse, Ortwin
Adams, Marcel Andree, Sandra Hauka, Torsten Feldt, Björn-Erik
Jensen, Verena Keitel, Detlef Kindgen-Milles, Jörg Timm, Klaus
Pfeffer, Alexander T Dilthey:
"Genetic structure of SARS-CoV-2 reflects clonal superspreading
and multiple independent introduction events, North-Rhine
Westphalia, Germany, February and March 2020", Euro Surveill.,
2020;25(22):pii=2000746. DOI:
10.2807/1560-7917.ES.2020.25.22.2000746
Andreas Walker, Torsten Houwaart, Patrick Finzer,
Lutz Ehlkes, Alona Tyshaieva, Maximilian Damagnez, Daniel
Strelow, Ashley Duplessis, Jessica Nicolai, Tobias Wienemann,
Teresa Tamayo, Malte Kohns Vasconcelos, Lisanna Hülse, Katrin
Hoffmann, Nadine Lübke, Sandra Hauka, Marcel Andree, Martin P
Däumer, Alexander Thielen, Susanne Kolbe-Busch, Klaus Göbels,
Rainer Zotz, Klaus Pfeffer, Jörg Timm, Alexander T Dilthey,
German COVID-19 OMICS Initiative (DeCOI):
"Characterization of SARS-CoV-2 infection clusters based on
integrated genomic surveillance, outbreak analysis and contact
tracing in an urban setting", Clinical Infectious Diseases,
2021; ciab588, DOI: 10.1093/cid/ciab588
Informationen zu Prof. Dr. Alexander
Dilthey:
https://www.uniklinik-duesseldorf.de/patienten-besucher/klinikeninstitutezentren/institut-fuer-medizinische-mikrobiologie-und-krankenhaushygiene/forschung-arbeitsgruppen/dr-alexander-dilthey
Informationen zu Dr. Torsten Houwaart:
https://www.researchgate.net/scientific-contributions/Torsten-Houwaart-2064287257
Offizielle Informationen über SARS-CoV2 des Bundesministeriums
für Gesundheit.
Danke an Mino und Cono Bender für ihr tolles "Und jetzt ist
Schluss".
Soundtrack und Produktion: Dr. Stephan Raub
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